Diese JRPs ermöglichen es Forschenden in der Schweiz, zusammen mit Forschenden der Partnerländer spezifische Forschungsfragen zu behandeln. Die Projekte dauern üblicherweise drei Jahre. Es werden ähnliche Kategorien wie in der SNF-Projektförderung finanziert (Geräte, Verbrauchsmaterial und Reisekosten sowie Saläre). Der SNF organisiert die Ausschreibungen gemeinsam mit einer oder zwei Partnerorganisationen im betreffenden Land. Die erfolgreichen Projekte werden von beiden Ländern gemeinsam finanziert, wobei jede Organisation die Forschenden in ihrem eigenen Land finanziert. Die meisten Ausschreibungen sind thematisch begrenzt; die Themen wurden aufgrund ihrer Relevanz für die beiden jeweils involvierten Länder ausgewählt.